单细胞ATAC-seq(Aaasay for transposase Accessible Chromatin with high throughput sequencing at the single cell level) 是指在单细胞水平上检测开放染色质的方法。其原理为基于Tn5转座酶对片段化
流程图示 (二)分析流程三、单细胞ATAC测序性能分析 1.单细胞分辨率下的表观基因组研究 2.低线粒体reads数(例如,GM12878细胞
伯豪生物单细胞多组学 ATAC+RNA 联合检测服务,是基于 10X Genomics 平台,对数千个细胞中的每一细胞内的 RNA 和染色质可及性同时检测的新技术。通过这项技术能够测定调控区域对基因表达的影响,从而在目标细胞内实现信息的关联;根据两种分子信息可以更深入地表征复杂的细胞群,捕获细胞异质
(scATAC)基于转座酶介导的测序引物插入开放的染色质区域。像普通的ATAC-Seq一样,该测定法提供了染色质开放和可及区域的轮廓,这些轮廓指示了单细胞分辨率下的活跃调控区域。我们的scATAC-Seq
ATAC-Seq由于所需细胞量少,实验简单,可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态,目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。
ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究新策略
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